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tm值与退火温度

1.一般来说,较低的退火温度可以提高pcr反应的敏感性但特异性较差;而较高的退火温度则可以提高pcr的特异性但却降低了扩增效率。通常引物与模板的退火温度在45-55度。 2.优化退火温度最好的方法是设置一系列对照反应,即通过在低于计算出的引物T...

不同的PCR MIX所设置的退火温度是不一样的,有的比最低Tm值低5℃,有的低3℃,请你参考你所买的PCR MIX的说明书,上面肯定有详细说明。 一般PCR比最低Tm值低1-5℃,都没什么问题。 RT-PCR的文献上,有推荐的设计软件,也有推荐的PCR MIX,跟着说明...

我用primer 5设计出来的Tm值从来都是直接当退火温度用。用引物primer-blast的话我都是直接贴序列上去。有其他菌的匹配很正常,有些进化亲缘性很近的,只要在同一物种中没有匹配上的问题应该不大!

首先告诉你,Tm值没什么用的,你要注意的是退火温度,比如这是我做16S rDNA的程序, 1)95度 10min(这个一般用94-95度,使DNA完全分开,这步一般固定) 2)95度 30秒(94度、95度都可以,这步几乎也是固定的) 3)退火温度 30-60秒(退火温度你...

退火温度与引物的TM值的关系主要和DNA聚合酶与其buffer有关。 有些退火温度要比TM低5度、3度,有些还会高3度,有些是一模一样的。主要参考不同公司所生产的DNA聚合酶的说明书。

Tm指的是把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。 我们PCR时候,当然不能用Tm值来作为退火的温度。一般来说,退火温度比Tm值要低上5度左右。但是这个也不是绝对的。建议你如果说模板比较充足的话,做一个梯度试验。

从原理角度分析,在Tm值的温度下,引物只能1半与模板DNA结合,低几度就全结合上去了.PCR扩增时需要引物完全结合到模板上才行.

计算退火温度的方法: 1. 退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8) 只是粗算,有时不灵,但比较简便。 2.用primer5(or oligo6)计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2 or 3度最好。 3.合成引物...

55°C左右吧~一般退火温度比Tm值低5度~但要确定一下你的polymerase适用的退火温度~比如pfu一般不要低于60°C~Taq不低于55°C即可~

计算退火温度的方法: 1. 退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8) 只是粗算,有时不灵,但比较简便。 2.用primer5(or oligo6)计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2 or 3度最好。 3.合成引物...

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